El Prius viene equipado de fábrica con tres airbagss frontales (para conductor, pasajero y rodillas del conductor), dos airbagss laterales (para pasajeros delanteros) y dos de cortina (que cubren las dos filas de asientos).
Los airbagss abren según el ángulo, velocidad y objeto contra el cual se impacta, ofreciendo excelente seguridad según sea necesario.
El airbags del pasajero frontal cuenta con un sensor de uso (no dispara el airbag si no lleva pasajero) y un interruptor manual para activar-desactivar el airbags.
Los cinturones frontales del Prius cuentan con ELR (Emergency Locking Retractor) que fija el cinturón en un movimiento brusco, y pretensores y limitadores de fuerza. Los pretensores trancan el cinturón en su lugar en un accidente, y los limitadores de fuerza reducen la fuerza aplicada por el cinturón para minimizar lesiones en el torso.
El chasis ha sido diseñado para un excelente desempeño en impactos frontales, laterales y traseros, al igual que peatonales. Estructuras que refuerzan la parte frontal (sobre todo a nivel de las rodillas), el techo y los marcos de las puertas dispersan la energía y minimizan la deformación de la cabina. Para peatones, el parachoques frontal cuenta con materiales absorbentes y el capot cuenta con una estructura que minimiza la severidad de los impactos.